| SEMA3A | Q14563 | CLCA2-201 | ENST00000370565 | 4025 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1243P-201 | ENST00000364028 | 107 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | C1orf105-203 | ENST00000367727 | 985 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ANP32E-202 | ENST00000369115 | 708 nt | TSL 3 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.390-201 | ENST00000383932 | 102 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TRAJ35-201 | ENST00000390502 | 59 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPS4XP9-201 | ENST00000405151 | 780 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU2-66P-201 | ENST00000410650 | 161 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL078590.1-201 | ENST00000412602 | 479 nt | TSL 3 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | OR8G2P-201 | ENST00000412796 | 908 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC00894-201 | ENST00000413076 | 403 nt | TSL 3 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ABCC5-AS1-201 | ENST00000422946 | 469 nt | TSL 2 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RBMY1KP-201 | ENST00000423480 | 476 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | EIF1P3-201 | ENST00000423841 | 334 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTCO2P19-201 | ENST00000427513 | 598 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC131571.1-201 | ENST00000429821 | 577 nt | TSL 5 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ZYG11AP1-201 | ENST00000430329 | 837 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | OR2B8P-201 | ENST00000432841 | 938 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HLA-N-201 | ENST00000437516 | 135 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL7P28-201 | ENST00000437739 | 740 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL121601.2-201 | ENST00000438019 | 707 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNRPEP7-201 | ENST00000438350 | 220 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC092641.1-201 | ENST00000440229 | 772 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC00113-203 | ENST00000442550 | 572 nt | TSL 3 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | RPL23AP24-201 | ENST00000458203 | 385 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC098851.1-201 | ENST00000476561 | 570 nt | TSL 4 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC116353.2-201 | ENST00000505332 | 712 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC01957-201 | ENST00000506392 | 751 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | NREP-AS1-202 | ENST00000507222 | 610 nt | TSL 3 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CDC42P4-201 | ENST00000510507 | 563 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC02364-201 | ENST00000514802 | 687 nt | TSL 2 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP73-201 | ENST00000516744 | 108 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC108449.1-202 | ENST00000517632 | 478 nt | TSL 3 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC107373.1-201 | ENST00000522570 | 603 nt | TSL 3 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | OR4R3P-201 | ENST00000525084 | 838 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC116535.2-201 | ENST00000532365 | 441 nt | TSL 5 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC006064.5-201 | ENST00000541782 | 248 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | OR6C7P-201 | ENST00000547875 | 934 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC069228.1-202 | ENST00000550272 | 737 nt | TSL 3 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ZNF519P3-201 | ENST00000557158 | 1032 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PCMTD1P2-201 | ENST00000565017 | 355 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC01533-202 | ENST00000588694 | 632 nt | TSL 2 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL157938.2-204 | ENST00000589667 | 826 nt | TSL 5 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC011518.1-202 | ENST00000592668 | 407 nt | TSL 5 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC007687.1-201 | ENST00000602704 | 304 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC068790.5-201 | ENST00000602741 | 355 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL353621.2-201 | ENST00000605340 | 133 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LARP7P1-201 | ENST00000605576 | 316 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC012360.2-201 | ENST00000609349 | 391 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC01002-236 | ENST00000634022 | 378 nt | TSL 5 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ADGRL2-208 | ENST00000370725 | 5293 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTTP-201 | ENST00000265517 | 4037 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CCDC178-205 | ENST00000406524 | 3039 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PUS7L-207 | ENST00000551923 | 3313 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ELL2P4-201 | ENST00000446870 | 1376 nt | BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ZNF117-203 | ENST00000610793 | 1374 nt | TSL 2 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CFAP221-215 | ENST00000598644 | 1532 nt | TSL 2 BASIC | 4.26 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SETDB2-202 | ENST00000317257 | 5619 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | BAZ2B-204 | ENST00000392783 | 8289 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | WDR49-207 | ENST00000479765 | 2108 nt | TSL 2 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL122126.1-201 | ENST00000546905 | 1318 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LRRC39-203 | ENST00000370138 | 1466 nt | TSL 5 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL158163.1-201 | ENST00000603915 | 1649 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | R3HCC1L-205 | ENST00000612478 | 3337 nt | TSL 5 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | FAM49B-212 | ENST00000519110 | 1902 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PLCL2-202 | ENST00000432376 | 3940 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | IFI16-208 | ENST00000448393 | 2245 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ATP7A-201 | ENST00000341514 | 8483 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CNTN6-201 | ENST00000350110 | 3814 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR448-201 | ENST00000362131 | 111 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-660P-201 | ENST00000364566 | 109 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.303-201 | ENST00000364998 | 94 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA51.6-201 | ENST00000384151 | 125 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | EIF5P1-201 | ENST00000400019 | 1231 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL31-205 | ENST00000409320 | 716 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC112721.2-201 | ENST00000409910 | 541 nt | TSL 4 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPS23P10-201 | ENST00000416185 | 486 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC00276-201 | ENST00000417751 | 596 nt | TSL 2 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC105399.1-201 | ENST00000422418 | 418 nt | TSL 2 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL391336.1-201 | ENST00000424678 | 484 nt | TSL 3 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | BBS9-205 | ENST00000425508 | 1252 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC00457-201 | ENST00000428706 | 413 nt | TSL 3 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPS29P17-201 | ENST00000430795 | 166 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL356277.3-201 | ENST00000432484 | 618 nt | TSL 3 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CKS1BP5-201 | ENST00000434172 | 273 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPS3AP54-201 | ENST00000435535 | 734 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL23AP74-201 | ENST00000437246 | 471 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC00366-201 | ENST00000441430 | 435 nt | TSL 2 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC096558.1-202 | ENST00000442794 | 561 nt | TSL 4 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | COX6CP2-201 | ENST00000444980 | 225 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AP000844.1-201 | ENST00000446631 | 577 nt | TSL 3 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPS20P32-201 | ENST00000456044 | 356 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC016751.1-201 | ENST00000458254 | 306 nt | TSL 3 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | FO393408.1-201 | ENST00000458577 | 582 nt | TSL 5 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPS15AP17-201 | ENST00000470598 | 390 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PLS1-AS1-201 | ENST00000485338 | 346 nt | TSL 3 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RN7SL810P-201 | ENST00000493031 | 276 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RN7SL691P-201 | ENST00000494487 | 301 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |