Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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