Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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