Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
APOFQ13790 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms