Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC022296.2-201ENST00000512424 202 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms