Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCOF1Q13428 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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