Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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