Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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TRAF3Q13114 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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TRAF3Q13114 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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TRAF3Q13114 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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TRAF3Q13114 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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TRAF3Q13114 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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TRAF3Q13114 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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TRAF3Q13114 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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TRAF3Q13114 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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