Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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