Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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CSTF3Q12996 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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CSTF3Q12996 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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CSTF3Q12996 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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CSTF3Q12996 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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