Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms