Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.3 ms