Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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