Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms