Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LRRIQ1Q96JM4 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRIQ1Q96JM4 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRIQ1Q96JM4 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRIQ1Q96JM4 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LRRIQ1Q96JM4 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms