Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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CHCHD4Q8N4Q1 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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CHCHD4Q8N4Q1 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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CHCHD4Q8N4Q1 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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CHCHD4Q8N4Q1 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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CHCHD4Q8N4Q1 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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CHCHD4Q8N4Q1 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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CHCHD4Q8N4Q1 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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