Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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RNF20Q5VTR2 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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RNF20Q5VTR2 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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RNF20Q5VTR2 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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RNF20Q5VTR2 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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RNF20Q5VTR2 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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RNF20Q5VTR2 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RNF20Q5VTR2 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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