Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 TTTY25P-201ENST00000558356 1505 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 TTC9C-202ENST00000316461 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP379-201ENST00000364599 113 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP78-201ENST00000364622 118 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC008937.2-201ENST00000415589 619 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 Z98747.1-201ENST00000438791 356 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RN7SL449P-201ENST00000464937 286 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC003991.2-201ENST00000520993 576 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC136944.5-201ENST00000573021 151 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC005828.5-201ENST00000582741 355 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL355989.2-201ENST00000603304 512 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC108451.2-201ENST00000603875 538 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AP000356.4-201ENST00000639500 172 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LINC02282-201ENST00000535153 1655 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms