Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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SP6Q3SY56 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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SP6Q3SY56 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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SP6Q3SY56 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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SP6Q3SY56 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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SP6Q3SY56 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SP6Q3SY56 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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