Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC021242.2-202ENST00000522129 545 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Q1T7F1 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC078929.1-201ENST00000547679 502 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Q1T7F1 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
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