Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms