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| UPP1 | Q16831 | AC026407.1-201 | ENST00000518369 | 204 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | PTP4A1P6-201 | ENST00000531034 | 478 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AP001317.1-201 | ENST00000531194 | 960 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | LRRC34P1-201 | ENST00000542742 | 915 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | CACNA1C-AS4-201 | ENST00000544415 | 735 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | GMFB-208 | ENST00000554908 | 6721 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC012493.2-201 | ENST00000595083 | 291 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC107952.2-201 | ENST00000606048 | 486 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC007349.4-201 | ENST00000608114 | 532 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | Z98949.1-212 | ENST00000609820 | 837 nt | TSL 5 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC004825.2-201 | ENST00000616634 | 455 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC244517.5-201 | ENST00000624139 | 722 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | CRISP1-202 | ENST00000335847 | 1911 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | SYNE1-207 | ENST00000367255 | 27748 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | SLITRK4-203 | ENST00000596188 | 8545 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | ADAM5-201 | ENST00000359790 | 1663 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | PPIP5K2-215 | ENST00000613674 | 4933 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC009237.2-201 | ENST00000421358 | 284 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC011979.1-201 | ENST00000472300 | 483 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | ACTG1P13-201 | ENST00000486987 | 1043 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC069444.1-201 | ENST00000489428 | 266 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC114322.1-201 | ENST00000506771 | 926 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC018752.1-201 | ENST00000507813 | 206 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC018797.3-201 | ENST00000513388 | 1241 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC068672.1-201 | ENST00000520391 | 328 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC011586.1-201 | ENST00000521055 | 458 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC079098.1-202 | ENST00000523150 | 573 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC118942.1-202 | ENST00000529081 | 578 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | CCDC7-207 | ENST00000535327 | 700 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | CCDC7-208 | ENST00000537047 | 657 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC087463.3-201 | ENST00000570105 | 415 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR5004-201 | ENST00000579078 | 107 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC069545.1-201 | ENST00000605671 | 358 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC007563.2-202 | ENST00000607591 | 394 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC107075.1-201 | ENST00000613695 | 314 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | CNBD1-207 | ENST00000620844 | 876 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | PSMA5-201 | ENST00000271308 | 3729 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | C8orf34-202 | ENST00000337103 | 3652 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | KIF21A-203 | ENST00000541463 | 4866 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | XPOTP1-201 | ENST00000443317 | 2398 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AKAP6-201 | ENST00000280979 | 15006 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AP001486.2-201 | ENST00000561652 | 5113 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | WNK3-205 | ENST00000620763 | 5400 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | C1orf112-203 | ENST00000413811 | 2661 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | SULT1E1-201 | ENST00000226444 | 1780 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | BIRC3-201 | ENST00000263464 | 5197 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | FOXP2-224 | ENST00000635534 | 4290 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | ZNF876P-202 | ENST00000398732 | 1485 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | TUBD1-214 | ENST00000592426 | 1460 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | CRISPLD1-205 | ENST00000523524 | 2100 nt | TSL 2 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | MBNL1-220 | ENST00000493459 | 4205 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | SEPT7P7-201 | ENST00000420492 | 1301 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL499616.1-201 | ENST00000415437 | 2633 nt | TSL 2 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | CAPZA3-201 | ENST00000317658 | 1087 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-525P-201 | ENST00000363685 | 104 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | RPL17P50-201 | ENST00000396131 | 546 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | DSTNP4-201 | ENST00000399472 | 474 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC126124.2-201 | ENST00000413542 | 321 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC091390.3-201 | ENST00000426478 | 338 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | OPA1-AS1-201 | ENST00000433105 | 492 nt | TSL 3 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | HSD52-202 | ENST00000436225 | 772 nt | TSL 3 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC006028.1-201 | ENST00000438379 | 402 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC010975.1-201 | ENST00000443301 | 669 nt | TSL 3 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORD108-201 | ENST00000459332 | 71 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | RAD51AP1P1-201 | ENST00000484195 | 1001 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| UPP1 | Q16831 | LINC02049-201 | ENST00000490647 | 747 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |