Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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