Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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