Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
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ZNF239Q16600 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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ZNF239Q16600 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
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