Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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SNAPC1Q16533 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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SNAPC1Q16533 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SNAPC1Q16533 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SNAPC1Q16533 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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SNAPC1Q16533 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SNAPC1Q16533 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SNAPC1Q16533 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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SNAPC1Q16533 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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