Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 475.2 ms