Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.17
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HERC1Q15751 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.17
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HERC1Q15751 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.17
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HERC1Q15751 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
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