Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.3 ms