Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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PTPRKQ15262 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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PTPRKQ15262 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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PTPRKQ15262 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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PTPRKQ15262 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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PTPRKQ15262 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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PTPRKQ15262 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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PTPRKQ15262 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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