Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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