Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
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