Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms