Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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COL4A6Q14031 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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COL4A6Q14031 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
COL4A6Q14031 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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COL4A6Q14031 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
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COL4A6Q14031 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
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COL4A6Q14031 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
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COL4A6Q14031 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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COL4A6Q14031 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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COL4A6Q14031 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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COL4A6Q14031 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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