Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCINQ13939 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCINQ13939 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms