Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms