Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms