Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
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PKD2Q13563 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
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PKD2Q13563 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
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PKD2Q13563 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
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PKD2Q13563 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
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PKD2Q13563 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
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PKD2Q13563 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
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PKD2Q13563 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PKD2Q13563 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
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