Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
C1orf61Q13536 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms