Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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FOXE3Q13461 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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