Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms