Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms