Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms