Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NME3Q13232 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NME3Q13232 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NME3Q13232 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NME3Q13232 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NME3Q13232 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NME3Q13232 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NME3Q13232 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NME3Q13232 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NME3Q13232 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NME3Q13232 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NME3Q13232 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NME3Q13232 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NME3Q13232 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NME3Q13232 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms