Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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