Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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GRIK2Q13002 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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GRIK2Q13002 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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