Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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FOXO1Q12778 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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FOXO1Q12778 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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FOXO1Q12778 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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FOXO1Q12778 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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FOXO1Q12778 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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FOXO1Q12778 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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