Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms