Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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LMOD1P29536 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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LMOD1P29536 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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LMOD1P29536 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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LMOD1P29536 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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LMOD1P29536 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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LMOD1P29536 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LMOD1P29536 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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