Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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PTPRMP28827 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRMP28827 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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